%0 Journal Article
%A 王子寅
%A 刘秉儒
%A 李子豪
%A 王继飞
%A 杨鹏斌
%T 基于Survey分析的濒危植物四合木基因组研究
%D 2023
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2023.02.004
%J 植物研究
%P 186-193
%V 43
%N 2
%X <p>评价濒危植物四合木（<i>Tetraena</i><i>mongolica</i>）基因组的大小及复杂程度，开展基因组研究可揭示四合木的超旱生机制，进一步挖掘其特色基因资源。为更好破解四合木的全基因组信息，采用第二代高通量测序技术的基因组Survey分析技术开展四合木基因组大小估测研究，并利用生物信息学方法估计了四合木杂合率、重复序列和GC含量等基因组信息。结果表明：四合木基因组大小为1 079.25 Mb，修正后的基因组大小为1 065.84 Mb，杂合率为0.76%，重复序列比例为75.25%，GC含量为33.57%。在经过四合木基因组初步组装后，获得3 502 126条contigs，总计682 Mb，其N50为187 bp，推测四合木基因组属于同源四倍体复杂基因组，全基因组测序组装难度较大。由于四合木的高杂合率，后续可采用第三代高通量测序技术（单分子测序）同时结合染色质区域捕获技术，有望最终获得高质量的四合木全基因图谱。</p>
%U https://bbr.nefu.edu.cn/CN/10.7525/j.issn.1673-5102.2023.02.004